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circRNA研究匯總 | 20190930-1006
來源: | 作者:geneseed | 發布時間: 2019-10-08 | 989 次瀏覽 | 分享到:

歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發布的circRNA文獻22篇,下面我們一起來看看circRNA研究最近有哪些新進展。

 

1、人腦中環狀RNA表達情況研究

標題:The Landscape of Circular RNA Expression in the Human Brain.

雜志:Biol Psychiatry  

影響因子:11.501

通訊作者:Irina Voineagu(澳大利亞新南威爾士大學)

 

在該研究中,研究者主要針對近200個健康對照和自閉癥病例的人腦組織樣本中circRNA進行表達譜研究。最終鑒定到幾百種全新circRNAs,且發現這些circRNA不是隨機表達,具有主要表達模式的亞型。CircRNA表達在個體間的變異性不如大腦皮層和小腦之間的變異性明顯。最后,研究者鑒定了自閉癥樣本中上調的circRNA共表達模塊,從而為觀察到的自閉癥大腦中轉錄組變化增加了另一層復雜性。該研究為circRNA在大腦中的研究提供了一個全面的數據目錄,并提供了免費網頁工具查詢瀏覽這些circRNA表達數據,為circRNA在大腦中的進一步深入研究提供了重要參考資源。(資源網址http://www.voineagulab.unsw.edu.au/circ_rna)。


圖注:ZENBU基因組瀏覽器展示該文獻中的circRNA表達數據,circRNA以線條形式呈現,紅色代表表達值高,藍色代表表達值偏低。

 

2剪接因子衍生的環狀RNA——circUHRF1通過反饋回路加速口腔鱗狀細胞癌的發生

標題:Splicing factor derived circular RNA circUHRF1 accelerates oral squamous cell carcinoma tumorigenesis via feedback loop.

雜志:Cell Death And Differentiation

影響因子:8.086

通訊作者:武杰,Zihao Liu(天津醫科大學口腔醫學院)和王左敏(首都醫科大學北京朝陽醫院)

 

該研究主要在口腔鱗狀細胞癌(OSCC)中鑒定了新circRNA——circUHRF1(hsa_circ_0002185)的生物形成機制和致癌作用。研究結果表明circUHRF1在OSCC細胞和組織中明顯上調,circUHRF1的高表達與OSCC患者的不良預后密切相關。體外體內功能研究結果顯示circUHRF1促進OSCC增殖,遷移,侵襲和上皮間充質轉化(EMT),促進腫瘤生長。分子機制研究結果表明circUHRF1充當miR-526b-5p的海綿,從而上調c-Myc。轉錄因子c-Myc可以促進TGF-β1和ESRP1的轉錄。此外,剪接因子ESRP1通過靶向circUHRF1側翼內含子促進了circUHRF1的環化和形成circUHRF1/miR-526b-5p/c-Myc/TGF-β1/ESRP1形成了正反饋環路研究通過circUHRF1/miR-526b-5p/c-Myc/TGF-β1/ESRP1反饋環確定了circUHRF1在OSCC腫瘤發生和EMT中的致癌作用,從而闡明了circUHRF1對OSCC的致病機制,OSCC治療提供了潛在的治療靶標。該文獻詳細解讀,推薦閱讀歷史文章:Cell Death & Differentiation | 口腔鱗狀細胞癌中circUHRF1促癌機制


圖注:circUHRF1/miR-526b-5p/c-Myc/TGF-β1/ESRP1形成的反饋環路示意圖

 

3NUDT21調節肝細胞癌中circRNA環化和ceRNA串擾。

標題:NUDT21 regulates circRNA cyclization and ceRNA crosstalk in hepatocellular carcinom

雜志:Oncogene

影響因子:6.634

通訊作者:朱曲波(中南大學湘雅藥學院

 

NUDT21是一個保守的剪接因子,參與調控mRNA前體的組裝。NUDT21綁定在poly(A)上游有兩個UGUA元件形成二聚體環,從而阻止了CPSF介導mRNA前體裂解。作為關鍵的3'-UTR長度調控因子,敲低NUDT21(KD)將導致poly(A)位置近端選擇,從而減少了3'-

UTR長度。之前研究表明HCC(肝癌)中NUDT21低表達,低水平NUDT21患者的總生存期無病生存較短。NUDT21表達也與肝癌患者的不良臨床預后相關,例如較大的腫瘤,晚期腫瘤淋巴結轉移的較早階段遠處轉移。普遍的假設認為NUDT21減少縮短了各種致癌基因的3'-UTR,幫助癌基因成功躲避miRNA介導的抑制作用。但是,Poly A測序和TCGA RNA-Seq數據分析結果顯示腫瘤中大多數致癌基因3'-UTR的長度幾乎沒有發生變化。另一種機制假說認為,癌基因的3'-UTR縮短通過破壞ceRNA-crosstalk的方式反式抑制抑癌基因的表達 的可能性更大,這可能是NUDT21在癌細胞中起作用的主要方式。由于circRNA是重要的ceRNA,可與miRNA結合并影響靶mRNA的穩定性和翻譯效率,本文作者假設NUDT21缺失,除了導致3'-UTR縮短,還可以減少circRNA生物形成,然后釋放miRNA以抑制HCC中的腫瘤抑癌基因。通過一系列實驗結果表明,NUDT21的高表達對circRNA的形成至關重要,UGUA序列元件則對circRNA環化非常關鍵。HCC中敲低NUDT21可破壞circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA途徑,circRNA環化受到阻止,miRNA被釋放進而抑制一部分抑癌基因的表達,最終導致HCC細胞不受控增殖。


圖注:HCC肝癌中,NUDT21敲低后circRNA形成受到抑制

 

 

參考文獻列表


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